Kiedy pasażer zostaje zakwalifikowany do kontroli wtórnej, proces ten zazwyczaj wiąże się z bardziej szczegółowymi procedurami niż standardowe kontrole w punktach kontrolnych.

Mogą one obejmować szczegółowe, ręczne kontrole bagażu podręcznego, dodatkowe skanowanie lub przecieranie urządzeń elektronicznych w celu wykrycia pozostałości materiałów wybuchowych, dokładniejsze badanie rzeczy osobistych i wzmocnioną weryfikację tożsamości.

Choć cały proces może wydawać się uciążliwy i frustrujący, odbywa się on zgodnie z ustalonymi protokołami bezpieczeństwa, mającymi na celu ochronę wszystkich osób na pokładzie.

Przygotowanie może znacząco wpłynąć na poziom stresu związanego z tym doświadczeniem. Podróżni, którzy przybywają na lotnisko wcześniej, dają sobie dodatkowy czas na kontrolę bezpieczeństwa bez pośpiechu i stresu. Utrzymanie porządku w bagażu podręcznym, pakowanie elektroniki w łatwo dostępne miejsca oraz przestrzeganie wytycznych dotyczących płynów i odzieży również może usprawnić proces. Noszenie minimalnej ilości metalowych przedmiotów, wiedza o tym, które przedmioty należy zdjąć podczas kontroli bezpieczeństwa, a także zachowanie spokoju i współpracy przyczyniają się do szybszego rozwiązania problemu.